Baza Danych Ligandów Bialek Polish edition

Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektów dotycz?cych zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania leków. Projekty b?d?ce tematem pracy to baza danych ligandów bia?ek LIGANSdb oraz program do analizy rozk?adu oddzia?ywa? w bia?ku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dost?pny pod adresem http://crick.cm-uj.krakow.pl/ligandsdb. LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobów: przeszukiwanie po nazwach bia?ek dostarczaj?ce listy ligandów, które wi?? si? z dan? protein? oraz przeszukiwanie po nazwach ligandów którego rezultatem jest lista bia?ek, do których dany ligand si? wi??e. Dodatkowo przy ka?dym bia?ku za??czona jest informacja o pe?nionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC bia?ka je?eli kod taki posiada. Serwis ten powsta? w oparciu o baz? danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksów bia?ko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozk?adów oddzia?ywa? w bia?ku z naciskiem na ob-szar miejsca wi???cego ligand.